GRIB. Research Unit on Biomedical Informatics





News & activities

How fast could dinosaurs move?

How fast could dinosaurs move? How can we know the size of sauropods with the measurements of their femur? What methods are there to calculate the weight of dinosaurs? These are some of the doubts that can be solved with an app for mobile devices designed by the lecturer Antonio Monleón-Getino, from the Department of Genetics, Microbiology and Statistics of the University of Barcelona, in collaboration with Biel Stela from the PharmacoInformatics group of GRIB (IMIM-UPF).

This app will be a new pedagogical and communicative tool to help the youngest audience to discover some of the hidden secrets of the fossilized skeleton of one of the most known dinosaurs which created great inspiration in the field of cinema and contributed to create its legend: the Tyrannosaurus Rex. 

This collaboration with the researchers Antoni Monleón-Getino and Biel Stela is part of the scientific advice promoted by the Institut Català de Paleontologia Miquel Crusafont for the exhibition "T. Rex. La Trix, el tiranosaure més ben conservat del món", in CosmoCaixa (Barcelona).  

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Innovación abierta para mejorar la evaluación de la seguridad de los medicamentos

La prestigiosa revista científica Nature Reviews Drug Discovery acaba de publicar un comentario donde se muestran los excelentes resultados del proyecto eTOX que ha permitido un nuevo modelo de colaboración de las industrias farmacéuticas entre sí y también entre estas y el mundo académico, en el que se comparten datos y conocimientos con el fin de mejorar la evaluación toxicológica de los fármacos.

Más allá de los resultados obtenidos, que son extremadamente valiosos, el proyecto es un modelo de innovación abierta -Open Innovation- dónde diferentes actores públicos y privados se alían y colaboran activamente. 

"Con el proyecto eTOX hemos empezado vislumbrar el potencial de estos datos para construir modelos predictivos capaces de predecir efectos in vivo. Sin embargo, hay que incorporar efectos toxicodinámicos y analizar hasta qué punto los datos experimentales y las predicciones son extrapolables al ser humano. Con esta finalidad acabamos de iniciar el nuevo proyecto eTRANSAFE" explica Ferran Sanz, coordinador del proyecto y Director del GRIB (IMIM - UPF).

Un valor añadido del proyecto eTOX es el desarrollo de tecnologías que facilitan la transferencia de resultados de investigación a las empresas y la generación de resultados sostenibles, que pueden continuar siendo utilizados más allá de la finalización del proyecto.

Artículo de referencia: "Legacy data sharing to improve drug safety assessment: the eTOX project" Ferran Sanz, François Pognan, Thomas Steger-Hartmann, Carlos Díaz and eTOX (including Manuel Pastor). Nature Reviews Drug Discovery, 2017.

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Last project

eTRANSAFE

The project eTRANSAFE: Enhancing Translational Safety Assessment through Integrative Knowledge Management, aims to develop an advanced data integration infrastructure together with innovative computational methods to improve the security in drug development process. The project is funded by the Innovative Medicines Initiative (IMI 2) together with the pharmaceutical industry for the period 2017-2022 and is coordinated by the GRIB. 

http://www.etransafe.eu/

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Last publications

  • Pagès A, Dotu I, Pallarès-Albanell J, Martí E, Guigó R, Eyras E. The discovery potential of RNA processing profiles. Nucleic Acids Research, 2017; gkx1115 DOI: 10.1093/nar/gkx1115.
  • Frigola J, Sabarinathan R, Mularoni L, Muiños F, Gonzalez-Perez A, López-Bigas N. Reduced mutation rate in exons due to differential mismatch repair. Nat Genet, 2017. PMID: 29106418 .
  • Vidal E, Sayols S, Moran S, Guillaumet-Adkins A, Schroeder MP, Royo R, Orozco M, Gut M, Gut I, Lopez-Bigas N, Heyn H, Esteller M. A DNA methylation map of human cancer at single base-pair resolution. Oncogene, 2017; 36 (40): 5648-5657. PMID: 28581523 . DOI: 10.1038/onc.2017.176. Epub 2017 Jun 5..
  • Sultana J, Calabró M, Garcia-Serna R, Ferrajolo C, Crisafulli C, Mestres J, Trifirò' G. Biological substantiation of antipsychotic-associated pneumonia: Systematic literature review and computational analyses. PLoS ONE, 2017; 12(10): e0187034. PMID: 29077727 .

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